{"id":"https://openalex.org/G4583871663","display_name":"SFB 1309: Chemische Biologie epigenetischer Modifikationen","description":"Die zellul\u00e4ren Biomolek\u00fcle werden nach der DNA-Replikation, DNA-Transkription oder Proteintranslation, h\u00e4ufig chemisch modifiziert. DNA enth\u00e4lt modifizierte Nukleoside um die Diversit\u00e4t des genetischen Codes zu erh\u00f6hen, was ben\u00f6tigt wird um die Aktivit\u00e4t von Teilen des genetischen Systems zwischen aktiv und passiv zu schalten. RNA enth\u00e4lt nichtkanonische Nukleoside um diese mit Funktionen auszustatten jenseits der Informationscodierung z. B. zur Feinregulation des Dekodierungsprozesses oder um RNA in spezifischen Faltungen zu stabilisieren. Proteine werden modifiziert um deren Interaktion mit anderen Proteinen und Nukleins\u00e4uren, sowie die Verteilung in der Zelle und die Stabilit\u00e4t zu steuern. Die chemische Sprache an den Biomolek\u00fclen stellt eine neue epigenetische Ebene an Information dar, welche nicht in der DNA-Sequenz kodiert vorliegt. Der SFB 1309 hat das Ziel diese Informationsebene zu dekodieren und zu manipulieren. Im Bereich A studieren wir die Modifikationen an Oligonukleotiden. Im Bereich B stehen die Modifikationen an Proteinen im Fokus. Im Bereich C entwickeln wir neue Technologien um diese Informationsebene \u00fcberhaupt studierbar zu machen. Wir ben\u00f6tigen neue Sequenzier-Methoden zum Studium wo sich die modifizierten Nukleoside in der DNA oder RNA befinden. Neue massenspektrometrische Methoden werden ben\u00f6tigt um den Inhalt und die Dynamik von modifizierten Aminos\u00e4uren und Nukleosiden in den verschiedenen Biomolek\u00fclen zu entschl\u00fcsseln. Der SFB 1309 verwendet zum Erreichen der Ziele die Technologien der Chemischen Biologie. Die modifizierten Nukleoside werden chemisch synthetisiert durch modernste Chemie in L\u00f6sung. Festphasen-chemische Methoden werden angewandt um modifizierte DNA und RNA spezifisch zu synthetisieren. Die chemischen Werkzeuge werden kombiniert mit zellbiologischen Methoden um die Funktion der Modifikationschemie in vivo aufzukl\u00e4ren. Wir entwickeln hochselektive Molek\u00fcle zur Manipulation dieser epigenetischen Informationsebene und erschlie\u00dfen so neue Ans\u00e4tze zur Behandlung von Krankheiten. Die neuen analytischen Methoden erlauben uns die Vermessung der Verteilung der nicht-kanonischen Bausteine in der Biosph\u00e4re was es uns auch erm\u00f6glicht neue Krebsdiagnostika zu entwickeln. Wir kl\u00e4ren auf, wie diese nichtkanonischen Bausteine es multizellul\u00e4ren Organismen erm\u00f6glichen die transkriptionelle Aktivit\u00e4t zu regulieren. Das ist speziell wichtig w\u00e4hrend der zellul\u00e4ren Entwicklung und bei der neuronalen Differenzierung. Wir studieren auch evolutive Aspekte. Sind die nichtkanonischen Nukleoside in der RNA z. B. \u00dcberbleibsel einer fr\u00fchen RNA-Welt oder wurden sie erst sp\u00e4ter entwickelt um es dem Leben zu erm\u00f6glichen einen h\u00f6heren Level an Komplexit\u00e4t zu erreichen? Das \u00fcbergreifende Ziel im SFB 1309 ist es die chemische Sprache an Biomolek\u00fclen zu verstehen und Molek\u00fcle zu entwickeln mit denen diese Informationsebene manipuliert werden kann. Damit legen wir die Grundlagen f\u00fcr neue medizinische und diagnostische Entwicklungen.","funder_award_id":"325871075","funder":{"id":"https://openalex.org/F4320320879","display_name":"Deutsche 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